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Java Discussion :

Algorithme Tarjan défectueux


Sujet :

Java

  1. #1
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    Par défaut Algorithme Tarjan défectueux
    Bonjour,

    On m'a conseillé ce forum, je viens donc faire appel à votre aide pour un problème sur un algorithme Tarjan de détection de composantes fortement connexes dans un graphe orienté.

    Pour les curieux qui éventuellement ne connaitraient pas, voici le wiki très bien expliqué des composantes fortement connexes :

    http://fr.wikipedia.org/wiki/Composa...tement_connexe

    Donc voilà, un algorithme existe pour repérer ses composantes : L'algorithme de Tarjan. J'ai essayé de le coder moi-même, mais il semblerait que j'aie quelques soucis :

    Voici donc mon algorithme commenté. J'espère que quelqu'un sera en mesure de m'aider.

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    	// Applies Tarjan Algorithm on Graph : this.
    	public void TarjanAlgorithm() {
     
    		this.index = 0;
    		stack.clear();
     
    		if (this != null)
    		{
    			if(this.SetOfVertices != null)
    			{
    				for(Vertex V : SetOfVertices)
    				{
    					tarjan(V);
    				}
    			}
    		}
    	}
     
    	// Tarjan Function
    	public void tarjan(Vertex v) {
     
    		v.setIndex(index);
    // System.out.println("index de "+v.getNumber()+" : "+v.getIndex());
    		v.setLowLink(index);
    // System.out.println("lowlink de "+v.getNumber()+" : "+v.getLowLink());
     
    		// add to the stack
    		stack.add(v);
     
    // if(stack.contains(v)) System.out.println(v.getNumber()+" a bien été empilé");
     
    		index++;
     
    		// for each w of Adjacent Vertex of v
    		for(Vertex w : v.getAdjacentVertices()) 
    		{
    // System.out.println("passage dans les points adjacents au point "+v.getNumber()+" : "+w.getNumber());
     
    			// if w.index is undefined
    			if(w.getIndex() == -1)
    			{
    				tarjan(w);
    				v.setLowLink(Math.min(v.getLowLink(), w.getLowLink()));
    			}
    			else 
    			{
    // System.out.println("index de "+w.getNumber()+" : non nul");
    				if(stack.contains(w))
    				{
    					v.setLowLink(Math.min(v.getLowLink(), w.getIndex()));
    // System.out.println("La pile contient "+w.getNumber());
    				}
    			}
    		}
     
    		// SCC found
    		if(v.getIndex() == v.getLowLink())
    		{
    			ArrayList<Vertex> new_scc = new ArrayList<Vertex>();
     
    			// pop the stack
    			Vertex w = new Vertex() ;
     
    			// Pop stack and push scc
    			while( (w.getNumber() != v.getNumber()) && stack.size() != 0) {
    				int x = stack.size() -1;
    				w = stack.remove(x);
    				new_scc.add(w);
    			}
     
    			SCC scc = new SCC(new_scc);
    			Sccs.add(scc);
     
    			stack.clear();
    		}
    	}
    J'ai laissé les lignes de debug, elles pourront peut-être vous être utiles...

    Quelques informations utiles :

    - Cet algorithme est une méthode de la classe Graphe
    - Ils existent des classes Vertex, Edge, et SCC (Strongly Connected Component ou Composante Fortement Connexe)

  2. #2
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    Tu n'explique pas quel est le problème et quel est le résultat attendu
    N'oubliez pas de consulter les FAQ Java et les cours et tutoriels Java
    Que la force de la puissance soit avec le courage de ta sagesse.

  3. #3
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    Si tu veux avoir des réponses, le mieux, c'est de poster le code complet d'un exemple ou avec des données en entrée et un affichage de résultat qui ne fonctionne pas. Ca evitera a ceux qui veulent t'aider de devoir se farcir le cours complet et de se prendre la tete a faire fonctionner ton code

  4. #4
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    Oops désolé, je ne suis pas un habitué des forums

    Voilà le code complet : http://dl.free.fr/mcV7SwruJ (Il faut laisser "data" dans le même rep que "src" )

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    public class Edge {
     
    	private Vertex nodeFrom;
    	private Vertex nodeTo;
     
    	private Integer cost;
     
    	////////-------------------
     
     
    	// Creates Edge without cost equal to 0
    	public Edge(Vertex node_FROM, Vertex node_TO) {
    		this.nodeFrom = node_FROM;
    		this.nodeTo   = node_TO;
    		this.cost     = 0;
     
    		// Increments degree of vertices
    		this.nodeFrom.setDegree(this.nodeFrom.getDegree()+1);
    		this.nodeTo.setDegree(this.nodeTo.getDegree()+1);
    	}
     
    	public Edge(Vertex node_FROM, Vertex node_TO, Integer cost) {
    		this.nodeFrom = node_FROM;
    		this.nodeTo   = node_TO;
    		this.cost     = cost;
     
    		// Increments degree of vertices
    		this.nodeFrom.setDegree(this.nodeFrom.getDegree()+1);
    		this.nodeTo.setDegree(this.nodeTo.getDegree()+1);
    	}
     
     
    	////////-------------------
     
    	public void print(){
    		System.out.print("("+this.nodeFrom.getNumber()+","+this.nodeTo.getNumber()+")");
    	}
     
    	public Vertex getNodeFrom() {
    		return nodeFrom;
    	}
     
     
    	public Vertex getNodeTo() {
    		return nodeTo;
    	}
     
    	public Integer getCost(){
    	    return cost;
    	}
    }
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    import java.io.*;
    import java.util.ArrayList;
    import java.util.StringTokenizer;
     
     
    public class Graph {
     
    	private ArrayList<Vertex> SetOfVertices  = new ArrayList<Vertex>(); // All Vertices of this
    	private ArrayList<Edge> SetOfEdges = new ArrayList<Edge>();			// ALl Edges of this
    	private ArrayList<SCC> Sccs = new ArrayList<SCC>();					// SCC of this (when they are detected)
     
    	private int NrVertices;
    	private int NrEdges;
     
    	// Used for Tarjan Algorithm only
    	private ArrayList<Vertex> stack = new ArrayList<Vertex>();
    	private int index;
     
    	public Graph(String namefile) throws IOException 
    	{
    		NrVertices = 0;
    		NrEdges    = 0;
     
    		// Get data from file
    		int data[][] = ReadFile(namefile);
     
    		// Creates NrVertices vertices
    		for(int i=1; i<=NrVertices;i++)
    			SetOfVertices.add(new Vertex(i));
     
    		// Creates edges from data
    		for(int j=0; j<NrVertices; j++)
    		{
    			for(int k=0; k<NrVertices; k++)
    			{
    				if(data[j][k] == 1)
    				{
    					SetOfEdges.add(new Edge(SetOfVertices.get(j),SetOfVertices.get(k)));
    					SetOfVertices.get(j).addAdjacentVertex(SetOfVertices.get(k));
     
    					NrEdges ++;
    				}
    			}
    		}
    	}
     
     
     
    	// Constructor
    	public int[][] ReadFile(String namefile) throws IOException
    	{
    			InputStream my_INStream = new FileInputStream(namefile); 
    			InputStreamReader my_INStream_Reader = new InputStreamReader(my_INStream);
    			BufferedReader br=new BufferedReader(my_INStream_Reader);
     
    			// recover dimension in file beginning
     			NrVertices = Integer.parseInt(br.readLine());
     
     			// Creates returned table with values
     			int values[][] = new int[NrVertices][NrVertices];
     
     			// used to recover each line
     			String line;
     
     			// iterator to the line
     			int numOfLines = 0;
     
     			// While we have still lines
    			while ( (line = br.readLine()) != null)
    			{
     
    				StringTokenizer lineTokenized = new StringTokenizer(line);
     
    				int numOfTokens = 0;
     
    				// Get data and store in a 2D table
    				while (lineTokenized.hasMoreTokens()) {
    					values[numOfLines][numOfTokens] = Integer.parseInt(lineTokenized.nextToken());
    					numOfTokens++;
    				}
     
    				numOfLines++;
    			}
    			br.close();
     
    			return values;
    	}
     
    	// Applies Tarjan Algorithm on Graph : this.
    	public void TarjanAlgorithm() {
     
    		this.index = 0;
    		stack.clear();
     
    		if (this != null)
    		{
    			if(this.SetOfVertices != null)
    			{
    				for(Vertex V : SetOfVertices)
    				{
    					// just if V isnt already in a SCC
    					if( V.isinSCC() == false )
    					{
    // System.out.println("Passage Tarjan général pour le poitn : "+V.getNumber());
    						tarjan(V);
    					}
    				}
    			}
    		}
    	}
     
    	// Tarjan Function
    	public void tarjan(Vertex v) {
     
    		v.setIndex(index);
    // System.out.println("index de "+v.getNumber()+" : "+v.getIndex());
    		v.setLowLink(index);
    // System.out.println("lowlink de "+v.getNumber()+" : "+v.getLowLink());
     
    		// add to the stack
    		stack.add(v);
     
    // if(stack.contains(v)) System.out.println(v.getNumber()+" a bien été empilé");
     
    		index++;
     
    		// for each w of Adjacent Vertex of v
    		for(Vertex w : v.getAdjacentVertices()) 
    		{
    // System.out.println("passage dans les points adjacents au point "+v.getNumber()+" : "+w.getNumber());
     
    			// if w.index is undefined
    			if(w.getIndex() == -1)
    			{
    				tarjan(w);
    				v.setLowLink(Math.min(v.getLowLink(), w.getLowLink()));
    			}
    			else 
    			{
    // System.out.println("index de "+w.getNumber()+" : non nul");
    				if(stack.contains(w))
    				{
    					v.setLowLink(Math.min(v.getLowLink(), w.getIndex()));
    // System.out.println("La pile contient "+w.getNumber());
    				}
    			}
    		}
     
    		// SCC found
    		if(v.getIndex() == v.getLowLink())
    		{
    // System.out.println("new SCC");			
     
    			SCC new_scc = new SCC();
     
    			// pop the stack
    			Vertex w = new Vertex() ;
     
    			// Pop stack and push scc
    			while( (w.getNumber() != v.getNumber()) && stack.size() != 0) {
    				int x = stack.size() -1;
    				w = stack.remove(x);
    				new_scc.add(w);
    				// update isinSCC param
    				w.setinSCC(true);
    			}
    			// add to the list of SCC
    			Sccs.add(new_scc);
     
    			new_scc.print();
     
    			// clear the stack
    			stack.clear();
    		}
    	}
     
    	public ArrayList<Edge> getEdges() {
    		return SetOfEdges;
    	}
     
    	public ArrayList<Vertex> getVertices() {
    		return SetOfVertices;
    	}
     
    	public ArrayList<SCC> getSCCs() {
    		return this.Sccs;
    	}
     
    	public void printEdges() {
    		for(int i=0 ; i<NrEdges ; i++)
    		{
    			SetOfEdges.get(i).print();
    			System.out.print(" , ");
    		}
    	}
    }
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    import java.util.ArrayList;
     
     
    public class Vertex {
     
        private int Number;      
     
        private ArrayList<Edge> outGoingEdges = new ArrayList<Edge>();
    	private ArrayList<Vertex> AdjacentVertices = new ArrayList<Vertex>();
    	private Integer Degree;
     
    	// used for Tarjan Algorithms
    	private Integer Index;
    	private Integer Lowlink;
        private boolean inSCC;
     
    	// Default construtor
        public Vertex(){
            this.init();
            this.Degree = 0;
            this.Index = -1;
        }
     
    	// Construtor
        public Vertex(int i){
            this.Number = i;
            this.Index= -1;
            this.Degree = 0;
        	this.init();
        }
     
        // Copy Constructor
        public Vertex(Vertex v) {
        	this.Number = v.getNumber();
        	this.Index = v.getIndex();
        	this.Degree = v.getDegree();
        	this.Lowlink = v.getLowLink();
        	this.outGoingEdges = v.getOutGoingEdges();
        	this.AdjacentVertices = v.getAdjacentVertices();
        	this.inSCC = v.isinSCC ();
        }
     
        // Add Vertex to Adjacent List of Vertices
        public void addAdjacentVertex (Vertex v) {
        	this.AdjacentVertices.add(v);
        }
     
        public int getNumberOfAdjacentVertices() {
     	   return AdjacentVertices.size();
        }
     
        public ArrayList<Vertex> getAdjacentVertices() {
        	return this.AdjacentVertices;
        }
     
        public int getNumber() {
        	return Number;
        }
     
    	// intialize the argument visited to false
        private void init(){
            this.inSCC = false;
        }
     
    	// inSCC Accessors 
    	public boolean isinSCC (){
    		return this.inSCC;
    	}
     
        public void setinSCC(boolean b) {
            this.inSCC = b;
        }
     
    	// return OutGoingEdges
        public ArrayList<Edge> getOutGoingEdges() {
            return outGoingEdges;
        }
     
    	// Degree Accessors
    	public Integer getDegree() {
    		return this.Degree;
    	}
     
    	public void setDegree(Integer d) {
    		this.Degree = d;
    	}
     
    	public Integer getIndex() {
    		return this.Index;
    	}
     
    	public void setIndex(Integer i) {
    		this.Index = i;
    	}
     
    	public Integer getLowLink() {
    		return this.Lowlink;
    	}
     
    	public void setLowLink(Integer l) {
    		this.Lowlink = l;
    	}
     
    	public void print() {
    		System.out.println("Vertex n° "+ this.Number);
    	}
     
    }
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    import java.util.ArrayList;
     
     
    public class SCC {
     
    	private ArrayList<Vertex> SetOfVertices = new ArrayList<Vertex>();
     
    	public SCC () {
    	}
     
    	public SCC (ArrayList<Vertex> v) {
    		SetOfVertices = v;
    	}
     
    	public ArrayList<Vertex> getSCC() {
    		return this.SetOfVertices;
    	}
     
    	public void print() {
    		System.out.print("{");
    		for(int i=0 ; i<this.SetOfVertices.size() ; i++){
    			System.out.print(this.SetOfVertices.get(i).getNumber()+",");
    		}
    		System.out.println("}");
    	}
     
    	public int getSize() {
    		return this.SetOfVertices.size();
    	}
     
    	public void add(Vertex x) {
    		SetOfVertices.add(x);
    	}
    }
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    import java.io.IOException;
     
    public class Main {
     
    	public static void main (String [] args) throws IOException
    	{
    		String file = "mat2.txt";
    		String path = "./data/"+file;
     
    		Graph G1 = new Graph(path);
     
    		// Print G1's edges
    		System.out.println("Edges :");
    		G1.printEdges();
     
    		System.out.println("\n \nDetection of Strongly Connected Component :");
     
    		G1.TarjanAlgorithm();
    		/*
    		for(SCC scc : G1.getSCCs()) {
    			scc.print();
    		}
    		*/	
    	}
    }
    Le problème en question :

    L'algorithme détecte certaines composantes, mais pas toutes. Dans un Graphe simple (une composante fortement connexe), il n'y a pas de problème, mais sur un graphe plus gros, il en oublie voir n'en trouve pas.

    Dans la version actuelle, il en trouve 2 sur 4 :

    L'algortithme sort :

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    {13,12,11,10,}
    {}
    {9,8,}
    {}
    {}
    {2,}
    {3,}
    {4,}
    {5,}
    {6,}
    {7,}
    Alors qu'il devrait trouver :

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    {13,12,11,10,}
    {9,8,}
    {5,6,7,}
    {1,2,3,4,}
    Voici le schéma du graphe dont les composantes fortement connexes sont représentées en bleu (Vive Paint ) :



    On peut essayer d'autres fichiers (dans le rep data) en modifiant l'attribut file en début de main.

  5. #5
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    Par défaut
    Bonjour,

    Je n'ai pas encore tout regardé, mais déjà deux remarques :

    - Dans la classe Graph.java, il est inutile de faire le faire if (this != null), car ce dernier sera toujours vrai ;
    - Dans cette même classe, j'ai l'impression que index n'est jamais initialisé ;

    Je ne sais pas si cela est une cause de tes problèmes par contre...

    Mako.

  6. #6
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    Par défaut
    Bonjour,

    Merci de prendre le temps de te pencher sur mon problème, ce n'est pas une tâche simple.

    Dans cette même classe, j'ai l'impression que index n'est jamais initialisé ;
    En fait si, il est initialisé plus bas, en première ligne de la méthode : TarjanAlgorithm() , c'est vrai que je l'ai omis dans le constructeur, enfin surtout parce que cet attribut sert uniquement pour l'algorithme Tarjan, (on l'incrémente et on attribut le nouvel index à l'attribut index propre à chaque Vertex.)

    La classe graph est la plus importante en fait, les autres ne sont là que pour structurer le graphe. Si tu as besoin de commentaires sur certains points et/ou lignes de codes, n'hésites pas à demander !

  7. #7
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    Avant de remettre en doute ton algorithme, assure-toi que les données en entrées sont correctes.
    Classe Graph, méthode tarjan, dernière instruction : tu es sûr de devoir vider ta stack ?
    Il me semblait qu'il fallait faire tourner l'algo tant que la stack contient des noeuds.
    N'oubliez pas de consulter les FAQ Java et les cours et tutoriels Java
    Que la force de la puissance soit avec le courage de ta sagesse.

  8. #8
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    Par défaut
    :O Quelle erreur de ma part !

    Voilà une erreur idiote qui m'a fait perdre beaucoup de temps, et à toi aussi (et peut-être d'autre)

    Lorsque je vide pas la pile l'algo tourne à merveille !

    Je crois que j'ai mal abordé mon problème et mon débogage, cela me servira de leçon !

    Merci beaucoup !

  9. #9
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    Par défaut
    Bonjour,

    S'il vous plait, quel est le contenu du fichier mat2.txt ?


    Merci.
    La science ne connaît qu'une loi: la contribution scientifique.

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