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Actualités Discussion :

.NET Bio : Microsoft cède la plateforme open source de bioinformatique

  1. #1
    Responsable .NET

    Avatar de Hinault Romaric
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    Par défaut .NET Bio : Microsoft cède la plateforme open source de bioinformatique
    .NET Bio : Microsoft cède la plateforme open source de bioinformatique
    à la fondation Outercurve


    Microsoft a procédé à la cession de son projet .NET Bio (anciennement connu sous le nom de Microsoft Biology Foundation) à la Fondation Outercurve, un organisme à but non lucratif, qui fournir un ensemble des solutions open source.

    .NET Bio est une plateforme construite comme une extension du Framework .NET, pour aider les developpeurs, chercheurs et scientifiques dans la création d’applications dans la recherche en bioinformatique. L’outil facilite la collaboration et accélère la recherche scientifique en permettant aux différents jeux de données de communiquer.

    La plateforme met en œuvre une gamme d’analyseurs pour les formats de fichiers communs bioinformatique, une gamme d’algorithmes pour manipuler l’ADN, l’ARN et des séquences de protéines, et un ensemble de connecteurs à des services web biologiques.

    Le projet sera désormais inclus dans « la galerie de la recherche accélératrice », qui héberge des projets open source et technologies utilisés par les scientifiques et les chercheurs des universités.

    Les travaux au sein de cette galerie vont permettre aux contributeurs du projet, d’augmenter la portée de celui-ci et améliorer les pratiques de développement communautaire, afin d’élargir les capacités d’utilisation de .NET Bio par les scientifiques.

    À travers la fondation Outercurve, les contributeurs au projet auront également des ressources pour soutenir les génomes plus complexes et plus grands, en travaillant avec des universités et des consortiums à travers le monde.

    La version 1.0 du projet .NET Bio a été publiée au cours de cette année et est pour l’instant téléchargeable avec les ressources associées sur le site Codeplex, sous licence Apache 2.0.

    Le projet sur Codeplex

    Source : CP Outercurve


    Et vous ?

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    Vous souhaitez participer aux rubriques .NET ? Contactez-moi

    Si déboguer est l’art de corriger les bugs, alors programmer est l’art d’en faire
    Mon blog, Mes articles, Me suivre sur Twitter
    En posant correctement votre problème, on trouve la moitié de la solution

  2. #2
    Expert confirmé
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    Bonjour

    Une solution .net. Pourquoi pas ? J'ignorais que ça existait.
    Maintenant quel avantage ? J'ai lu rapidement ce que ce framework faisait, on est loin de BioJava ou de BioPerl.
    N'oublions pas que ces frameworks sont utilisés par les universitaires. Le choix de Java ou de Perl (the language chez les bioinformaticiens) est alors acceptable.
    Maintenant pour des environnements tout microsoft, oui, ça aurait du sens d'opter pour cette solution, mais, par expérience pro depuis plus de 10 ans, les environnements bioinfo sont à 99% UNIX.
    D'un certain côté, ce projet ne demande qu'à grandir, disons que je réviserai mon opinion au bout d'un an.

    @++
    GLDavid
    Consultez la FAQ Perl ainsi que mes cours de Perl.
    N'oubliez pas les balises code ni le tag

    Je ne répond à aucune question technique par MP.

  3. #3
    Membre extrêmement actif Avatar de Jon Shannow
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    Citation Envoyé par GLDavid Voir le message
    les environnements bioinfo sont à 99% UNIX.
    Aurions-nous, ici, l'explication des problèmes Médiator, Gaucho et consort ?

    PS : C'est de l'humour (je préfère préciser car dans ce forum, certains font du 0°, en humour)
    Au nom du pèze, du fisc et du St Estephe
    Au nom du fric, on baisse son froc...

  4. #4
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    Microsoft a procédé à la cession de son projet .NET Bio
    Comprendre : Micro$oft abandonne son projet .NET Bio car personne ne l'utilise pour les raisons citées par GLDavid.

    Citation Envoyé par Jon Shannow Voir le message
    PS : C'est de l'humour (je préfère préciser car dans ce forum, certains font du 0°, en humour)
    L'humour de bas étage est le masque préféré du trolleur.
    Yoshi

    PS : tous les propos tenus dans le message ci-dessus sont à préfixer avec "A mon humble avis", "Je pense que". Il serait inutilement fastidieux de le rappeler à chaque phrase.

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