Discussion :

[Heimdall]

Hello :-)

J'ai un code en fortran 77, qui comporte entre autre choses, 5 gros tableaux, dont la taille est donnee par le parametre 'np'.

La valeur actuelle est : np = 36000000.
ce sont des tableaux de real, donc 4 octets je pense.
ca fait 4*36*1e6*5 = environ 600Mo de memoire.

Ca passe sans probleme. Si je passe a np = 200000000 (200 millions), j'ai cette erreur a la compilation :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
ld: in /var/folders/Rq/RqdW-0VZEaOgHSMXLVSZLk+++TQ/-Tmp-//ifortzg8sFo.o, malformed .o file, symbol _equil_ with address 0xEE6CC150 is not with section 5 (__DATA,__data) address range of 0x19720 to 0x19B00
make: *** [run] Error 1

Je ne comprend pas. np=200millionsm ca fait environ 3.7Go de memoire, et ma machine en possede 32Go.

Je suis pas tres habitue au fortran 77, je pensais que, ne possedant pas d'allocation dynamique, tous les tableaux allaient dans le stack... mais ma pile fait 8Mo donc a priori j'ai tord.

Voyez-vous comment solutionner le probleme ?

Merci !

[Ehouarn]

Bonjour,

Il est possible que ton problème vient du fait que tu dépasses les capacités d'indicage de tes gros tableaux (un indice est un entier, à priori codé par défaut sur 4 bits et de fait, si mes souvenirs sont bons, on se heurte à une barrière limitante correspondant à des tableaux individuels ne pouvant dépasser une taille de l'ordre de 2GB ).
Regarde dans la doc de ton compilateur; il suffit parfois simplement d'imposer que les entiers soient codés sur 8 bits et/ou ajouter une option de compilation pour gérer ce type de cas (du type "pic : position independent code" ou "large memory size" pour pouvoir avoir de objets de taille > 2GB, etc.)

Bonne continuation.

[Heimdall]

Hello,
Oui je crois que tu as raison !

cependant jai un probleme :

j'ai ca dans la doc :

This option tells the compiler to use a specific memory
model to generate code and store data. It can affect code
size and performance. If your program has COMMON blocks
and local data with a total size smaller than 2GB,
-mcmodel=small is sufficient. COMMONs larger than 2GB
require-mcmodel=medium or -mcmodel=large. Allocation of
memory larger than 2GB can be done with any setting of
-mcmodel.

IP-relative addressing requires only 32 bits, whereas
absolute addressing requires 64-bits. IP-relative address-
ing is somewhat faster. So, the small memory model has the
least impact on performance.

NOTE: When you specify -mcmodel=medium or -mcmodel=large,
you must also specify compiler option -shared-intel to
ensure that the correct dynamic versions of the Intel
run-time libraries are used.

Tells the linker to search for unresolved references in a
multithreaded, dynamic-link run-time library.

Mais lorsque j'ajoute -mcmodel=medium -shared-intel a mes options de compilation j'ai cette erreur :

/opt/openmpi64i/bin/mpif77 -m64 -mcmodel=large -shared-intel -o a.out version5LE_AsymHyb.f
ifort: command line warning #10152: option '-mcmodel large' not supported

Jutilise ifort 11.1.


Je comprends pas :-(

[Heimdall]

en fait maintenant je ne comprend meme plus pourquoi ca ne passe pas avec l'option par defaut qui est mcmodel=small.
car mon plus grand tableau fait 0.74Go.... ca devrait etre bon non ?


d'ou vient mon erreur de compilaiton alors :-/

[Ehouarn]

Mais lorsque j'ajoute -mcmodel=medium -shared-intel a mes options de compilation j'ai cette erreur :

/opt/openmpi64i/bin/mpif77 -m64 -mcmodel=large -shared-intel -o a.out version5LE_AsymHyb.f
ifort: command line warning #10152: option '-mcmodel large' not supported

Possible que ça coince parce que openmpi n'a pas été compilé avec l'option '-mcmodel=large -shared-intel' (idée en l'air; à part ça je ne vois pas trop).

en fait maintenant je ne comprend meme plus pourquoi ca ne passe pas avec l'option par defaut qui est mcmodel=small.
car mon plus grand tableau fait 0.74Go.... ca devrait etre bon non ?

Je dois bien avouer que je n'ai jamais compris si cette "limite" des 2GB d'adressage devait se comprendre au sens de l'intégralité des éléments du programme ou individuelement pour chaque tableau...

Désolé de ne pouvoir t'aider plus que ça.
Bon courage pour la suite.