proc glm et mesures répétées [Résolu]

[marlene2110]

bonjour, je dois analyser des données avec mesures répétées ms j'ai quelques petits problèmes quant à la forme des données.

Je dispose de 5 groupes et de données mesurées à t=0 t=2semaines et t=4semaines. Je dois effectuer une proc glm et une proc mixed, dont voici le code :

Code :

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proc glm DATA=DATA;
class groupn temps;
format groupn groupn.;
model Total0 TotalcW4=groupn temps groupn*temps;
repeated temps 2;
lsmeans groupn /  pdiff=control('vehicle') adjust=dunnett ;
means groupn / dunnett('vehicle');
run;
 
proc mixed DATA=DATA method=ML;
class groupn temps;
format groupn groupn.;
model Total=groupn temps groupn*temps / ddfm=kr outp=residuals; 
repeated temps /subject=mice type=un;
lsmeans groupn / diff=control('vehicle') adjust=dunnett;
run;

Par contre je voudrait savoir si la base doit etre construite de la même manière dans les deux cas? parce que dans la proc glm j'ai une table construite de la manière suivante :

Obs Mice Total0&2 Total4 groupn temps

1 26 2.41 6.86 1 0
2 35 2.28 6.27 1 0
.........................................
145 100 3.49 4.74 5 2
146 73 2.75 5.55 5 2

donc comme vous voyez j'ai une colonne avec les mesures à t0 et t2 puis une colonne temps (avec 0 et 2) et la colonne à t4(qui est ma variable à expliquer).

Est ce que vous pensez que c'est bon, ou bien je dois faire carrément une colonne avec le Total (à 0 2 et 4 semaines) et une colonne temps avec (0 2 et 4) et donc avoir une colonne en moins (je n'aurais qu'une colonne total), j'ai utilisé cette forme pour la proc mixed!

En espérant que vous puissiez m'aider.

Merci

[olivier.decourt]

Les 2 procédures n'attendent pas des données organisées pareil : dans GLM il y a une ligne par sujet et autant de variables que de mesures ; dans MIXED c'est une colonne par information, autant de lignes que de sujets*répétitions.
Bon courage.
PS : la proc MIXED est quand même largement préférable (plus d'options sur la forme des corrélations entre les répétitions)

[marlene2110]

merci!!

[Manoutz]

J'arrive peut etre apres la bataille...

Effectivement, pour le traitement des mesures repetees il est preferable d'utiliser la proc mixed a la proc glm.
Une des raisons principales est la proc glm fait du complete case: c'est a dire que la procedure va traiter les uniquement ID sans observations manquantes.

Autrement dit, des qu'une valeur sera manquante (donc a un temps, donne si tes mesures sont repetees dans le temps), GLM ne considerera aucune des observations de cet ID. C'est moche... Mixed quand a elle considerera toutes les visites non manquntes de l'ID - autrement dit toutes les informations disponibles.