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Discussion: PerlPrimer

  1. #1
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    Par défaut PerlPrimer

    Bonjour,

    Je vous propose un nouvel élément à utiliser : PerlPrimer

    Perlprimer est un logiciel gratuit, open-source de l'application GUI écrit en Perl, qui conçoit des amorces pour la PCR standard, bisulfite PCR, PCR en temps réel (QPCR) et le séquençage. Il vise à automatiser et à simplifier le processus de conception d'amorces.

    Qu'en pensez-vous ?

  2. #2
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    Par défaut

    Bonjour à tous,

    J'ai brièvement utilisé PerlPrimer que j'ai rapidement laissé tomber pour utiliser Primer3, gratuit et avec plusieurs modules sur le CPAN. J'ai ainsi pu écrire des scripts traitant en masse des séquences et automatisant, via ces modules, la génération d'amorces pour des PCR multiplexes. Primer3 existe également en ligne avec une interface graphique : http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0/

    Peut-être faudrait-il ajouter Primer3 à cette page de resource.
    -- Jasmine --

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