Discussion :

[alaninho]

Bonjour,

Voilà, j'ai plusieurs tableaux créés avec numpy, ensuite je crée une liste de ces tableaux, mais une fois dans la list, les tableaux n'ont plu le bon contenu.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def set_tab_sub_column(self,matrix, id_msa, list_seq):
        sub_col=sub_column.Sub_column()
        sub_col.init_tab(len(list_seq))
        i=0
        j=0
        while i<len(matrix[id_msa,0]):
            tab_column=sub_col.set_tab(matrix, i, id_msa)
            print tab_column
            self.tab_sub_column.append(tab_column)
            i=i+1
        print self.tab_sub_column

tab_column est un tableau créé par numpy
c dans self.tab_sub_column que je les ajoute.

Merci

Alaninho

[alaninho]

En faite, j'ai que le dernier tableau dans la list, je ne comprend pas, pourtant j'utilise append().

Alaninho

[josmiley]

faudrait voir toute la class ...

[mont29]

…Et mettre un print sur tab_sub_column dans la boucle while, histoire de voir son évolution…

[alaninho]

Quand j'imprime tab_column j'obtiens;

[ 43. 46. 37. 34.]
[ 44. 47. 38. 35.]
[ 45. 48. 39. 36.]
[ 46. 49. 40. 37.]
[ 47. 50. 41. 38.]
[ 48. 51. 42. 39.]
[ 49. 52. 43. 40.]
[ 50. 53. 44. 41.]
[ 51. 54. 45. 42.]
[ 52. 55. 46. 43.]
[ 53. 56. 47. 44.]
[ 54. 57. 48. 45.]
[ 55. 58. 49. 46.]
[ 56. 59. 50. 47.]
[ 0.5 0.5 0.5 48. ]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]
[ 0.5 0.5 0.5 0.5]

et quand j'imprime tab_sub_column :

[array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5]), array([ 0.5, 0.5, 0.5, 0.5])]

la class sub_column :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import numpy as np
 
class Sub_column:
    def __init__(self):
        self.tab=[]
 
    def init_tab(self, length):
        self.tab=np.zeros((length))
 
    def set_tab(self, matrix, pos_msa, id_msa):
        i=0
        while i<len(self.tab):
            self.tab[i]=matrix[id_msa, i, pos_msa]
            i=i+1
        return self.tab

Le reste de la classe Color_msa sert pas pour cette méthode :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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import numpy as np
import sub_column
 
class Color_msa:
    def __init__(self):
        self.tab=[[]]
        self.tab2=[[]]
        self.tab_sub_column=[]
 
    def set_tab_sub_column(self,matrix, id_msa, list_seq):
        sub_col=sub_column.Sub_column()
        sub_col.init_tab(len(list_seq))
        i=0
        j=0
        while i<len(matrix[id_msa,0]):
            tab_column=sub_col.set_tab(matrix, i, id_msa)
            #print tab_column
            self.tab_sub_column.append(tab_column)
            i=i+1
        print self.tab_sub_column

Voila j'espère que cela vous aidera plus pour m'aider.

Alaninho

[alaninho]

J'ai trouvé, je créai l'objet sub_column au mauvais endroit, que je suis idiot. J'ai perdu un tamps fou ç cause de ça, je dois finir mon projet vendredi.

Alaninho