[Lyon] Stage court non rémunéré C++ et HPC

[gbdivers]

Bonjour

Dans le cadre du développement d'outils informatiques destiné à l'analyse de données dans le domaine de la recherche biomédicale, l'Unité Médicale d'Oncologie Moléculaire et Transfert recherche des stagiaires pour travailler sur les approches de calculs haute performance.

Le sujet de ces stages est d'implémenter et tester des d'algorithmes d'analyse (principalement issus du traitement du signal) dans le framework que nous avons développé. L'étudiant travaillera à partir d'un article et implémentera une version dans R, une version C++ et différentes versions HPC (multithread, calcul distribué, GPGPU avec OpenCL). Il concevra également les tests unitaires (pour vérifier que l'algorithme donne le résultat attendu) et les benchmarks (pour évaluer les performances des implémentations).

Les prérequis pour ces stages sont d'avoir des connaissances de base en C++ (acquis en cours ou en autodidacte, un test sera proposer pour vérifier les bases en C++) et d'être motivé. Il n'y a pas de condition pour le niveau d'étude (bac+2 à bac+5) mais il faut obligatoirement avoir une convention de stage (je ne prend pas en stage des personnes qui ont fini leurs études). Les étudiants seront formés pour les différentes techniques avancées de HPC. Cela leur permettra de découvrir les possibilités actuelles en terme de calcul haute performance et les applications en biologie.

Ces stages sont de courtes durées non rémunéré (je prendrais également un stagiaire pour 6 mois mais qui travaillera uniquement sur l'interface graphique en Qt et OpenGL ; j'attends la confirmation pour le financement). Les stages peuvent se dérouler à plein temps (sur 2 mois) ou à temps partiel (plusieurs demi-journées sur une période de plusieurs mois, pour un total cumulé de 2 mois) au CHU de Lyon Sud.

Si vous êtes intéressé, vous pouvez m'envoyer CV et lettre de motivation à guillaume.belz@chu-lyon.fr


Ce stage fait suite au stage présenté ici.