Discussion :

[Krillz]

Bonjour,

Je cherche désespérément à lire des données dans un fichier texte (tab-delimited), et assigner ces données à des variables dont les noms sont aussi à récupérer dans le header du fichier en question.

Le fichier est organisé de manière assez classique :
- la première ligne contient une info pas utile
- la deuxieme ligne contient les noms des variables que je souhaite utiliser
- les lignes suivantes contiennet les données que je souhaite assigner aux variables sus-mentionnées

J'ai donc tant bien que mal écrit le script suivant, qui ne me fait pas d'erreur à la compilation, mais le résultat ne me convient pas. En effet il semble que les variables ne sont pas reconnues comme telles, mais plutôt comme des cell arrays.

Ca m'arrangerait beaucoup si vous pouviez jeter un oeil sur ce code. Je suis assez confus par rapport à l'utilisation des structures ou des cell arrays en particulier.

J'ai mis en PJ un exemple de fichier que je veux traiter. A noter que j'utilise la fonction 'readline' disponible ici :
http://www.mathworks.com/matlabcentr...exchange/20026

Un énorme merci pour votre aide

Code :

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clear all;
close all;
numsujet = 3; % le numero du sujet
numsession = 1; % la session
 
fname = ['chemin/Encodage' num2str(numsession) '_Sujet' num2str(numsujet) '_Data.txt'];
 
% Open text file
fid = fopen(fname);
 
% Find out number of rows in file
r=0;
x=0;
 
% Loop through data file until we get a -1 indicating EOF
while(x~=(-1))
    x=fgetl(fid);
    r=r+1;
end
r = r-1; % nb of rows
 
disp(['Number of rows = ' num2str(r)])
 
frewind(fid);
 
% Create varnames from second line of datafile
Vs = readline(fname,2);
 
colheaders = textscan(Vs,'%s');
colheaders = genvarname(colheaders{1,1});
 
c = length(colheaders); % nb of columns
disp(['Number of columns = ' num2str(c)])
 
fclose(fid);
 
% Use textscan to read each field as (possibly quoted) text
% Then step through every text field and replace it with an actual
% number if sscanf can convert it to one.
for i=3:r;
    line_i = readline(fname,i);
    line_i = textscan(line_i,'%q','delimiter','\t');
    for j=1:c;
 
        parsedisnum = sscanf(line_i{1,1}{1,1},'%f');
 
        % case sscanf fails to detect a float
        if isempty(parsedisnum) || numel(parsedisnum)<1
            a = line_i{1}(j);
 
        % case sscanf detects a float
        else
            a = parsedisnum;
        end
 
        suj.(colheaders{j})(i-2) = a;
    end
 
end

[Merel]

Salut,

personellement, je ne ferais pas comme ca. J'utiliserais tout simplement un textscan

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

help textscan

Ca te permet d'enlever l'entête et de récupérer tous tes champs avec les valeurs en une seule fois. La seule difficulté que tu renconteras concernera la délimitation des champs.

La délimitation est en tab sur l'ensemble de tes données mais également sur le chemin d'accès dans une de tes variables... Faut donc trouver l'astuce pour que textscan ignore ces deux tab du "documents and setting".

[Krillz]

Merci pour ta réponse,

La raison pour laquelle je n'ai pas utilisé textscan est que mes fichiers de données n'ont pas tous le même nombre de colonnes, et je voulais que mon code marche pour tous.

Et puis c'est pas très élégant d'écrire un truc comme textscan(ligne, %s %f %f %f ... x44 ), ou bien?

Et puis ça ne change pas fondamentalement mon problème concernant les cell arrays ou bien?

[Merel]

Mais pas de soucis,

C'était juste une remarque en passant. Ton script fonctionne très bien en utilisant readline.

Du coup, tu veux faire quoi ? Récupérer le nom des headers et leur assigner les valeurs du fichier ? Parce que c'est ce que tu as avec ta structure.

Tu prends suj.Duree et tu as bien toutes tes durées. C'est vrai que tu n'as pas de variable durée mais est ce que c'est un souci ?

Bref, c'est surement la fin de semaine mais je vois pas ce que tu veux faire

[Krillz]

En fait c'était plus à titre informatif, je me demandais si c'était propre comme code.

Et effectivement, comme tu le notes, j'aurais aimé que les 'Durees' et compagnie soient des variables. Ce n'est pas une nécessité absolue mais je me demandais comment m'y prendre. J'ai essayé de plusieurs façon mais ça ne compilait plus...

[Invité]

Bonjour,

Ton test pour savoir si c'est un float n'est pas bon

Code :

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close all;
numsujet = 3; % le numero du sujet
numsession = 1; % la session

fname = fullfile('chemin',['Encodage' num2str(numsession) '_Sujet' num2str(numsujet) '_Data.txt']); % Plus sécurisant
% Open text file
fid = fopen(fname);

% Find out number of rows in file
r=0;
x=0;

% Loop through data file until we get a -1 indicating EOF
while(x~=(-1))
    x=fgetl(fid);
    r=r+1;
end
r = r-1; % nb of rows

disp(['Number of rows = ' num2str(r)])

frewind(fid);

% Create varnames from second line of datafile
Vs = readline(fname,2);

colheaders = textscan(Vs,'%s');
colheaders = genvarname(colheaders{1,1});

c = length(colheaders); % nb of columns
disp(['Number of columns = ' num2str(c)])

fclose(fid);

% Use textscan to read each field as (possibly quoted) text
% Then step through every text field and replace it with an actual
% number if sscanf can convert it to one.
for i=3:r;
    line_i = readline(fname,i);
    line_i = textscan(line_i,'%q','delimiter','\t');
    for j=1:c;
        a = line_i{1}{j};
        % case sscanf fails to detect a float
        if ~isnumeric(a)
            suj.(colheaders{j})(i-2,1:length(a)) = a;
            % case sscanf detects a float
        else
            suj.(colheaders{j})(i-2) = a;
        end    
    end
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[Merel]

Je te laisse regarder la réponse de Winjerome.

Pour ce qui est de la création des noms de variables, tu peux regarder du côté de assignin

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

help assignin

Ca te permet de créer ce que tu souhaites faire.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

assignin('base',colheaders{1},suj.ExperimentName)

A toi de l'adapter à ton code.

[Krillz]

OK, merci pour vos réponses je pense que je vais m'en sortir maintenant.